Nie czytałeś dokładnie. Wprowadzenie danych obu baz danych (źródłowej i docelowej) odbywa się poprzez wklepanie danych obu baz do pliku impex/impexconfig.php .
Następnie w przeglądarce odpalasz skrypt konwersji (adres.pl/impex) i klikasz kolejno wszystkie opcje (ewentualnie bez associate users).