Masz rację, chmod samo w sobie oznacza zmianę, jednak jest to już popularnie używane określenie (chmod - prawa dostępu do katalogu). Nie powinniśmy tak pisać, jednak skoro staje się to potoczne... Niektórych rzeczy nie zmienisz idąc pod prąd.
W razie innych wątpliwości proponuję założyć oddzielny watek... Bo ten nie jest na temat rozpatrywanie pochodzenia/znaczenia zwrotu 'chmod'.